در واقع بخش انتهایی انجام پایان نامه فهرست بندی آن است. ترتیب دادن و شماره گذاری مطالب، تصاویر، نقشه ها، جداول و نمودارها برای یافتن سریع تر و دسته بندی آن ها، در فهرست بندی پایان نامه صورت می گیرد. فهرست بندی پایان نامه در بخش ابتدایی پایان نامه و قبل از قرار گیری مطالب قرار داده می شود. این بخش می تواند هم به صورت دستی و هم به شکل اتوماتیک در نرم افزارهای نوشتاری مانند ورد صورت گیرد. فهرست بندی پایان نامه باید به نحوی صورت گیرد که به طور مستقیم خواننده را به مطلب مورد نظر هدایت نماید.

شاید افراد در دیدگاه اول ویراستاری را تنها برای مطالبی می دانند که اشکالات زیادی داشته و باید در آن تجدید نظر شود در صورتی که این قضیه درست نیست. تدوین و تنظیم هر متنی به خصوص متون علمی پس از انجام آن نیازمند ویراستاری می باشد. ویراستاری پایان شامل اصلاح و ویرایش بخش هایی است که از دید نویسنده متن مخفی مانده و فرد دیگری با مطالعه و بازبینی متن آن را اصلاح می نماید. فرد ویراستار باید تسلط کافی به امر ویرایش داشته باشد البته باید در نظر داشت ویراستاری و ادیت متون علمی و تخصصی نیاز به مهارت علمی در آن موضوع و زمینه خاص دارد.

چکیده پایان نامه بخش مهمی از پایان نامه است که این بخش مورد بیشترین بازدید توسط افراد مختلف قرار خواهد گرفت. این بخش زمانی تدوین می شود که پایان نامه به اتمام رسیده و نتیجه گیری مورد نظر صورت گرفته باشد. مکان قرار گیری چکیده اصولا در اولین بخش پایان نامه و قبل از فهرست گذاری و مقدمه قرار می گیرد. چکیده پایان نامه باید به دو زبان فارسی و انگلیسی تنظیم شود.

اساسا پس از تدوین پایان نامه دانشجو موظف است پایان نامه را جهت بازخوانی به استاد راهنما و هم چنین استاد مشاور ارسال کند تا آن ها نیز نظر نهایی خود را بر آن اعمال کنند و اصولا بخش هایی از پایان نامه پس از بازدید آن ها نیازمند اصلاح و ادیت خواهد بود، البته پس از دفاع پایان نامه قسمت بعدی اصلاحیه هایی می باشد که داوران برای انجام پایان نامه از دانشجو خواستارند. اصلاح پایان نامه امکان دارد در مورد ادیت متن نگارشی و قواعد نشانه گذاری تا اصلاح متن و محتوای علمی داخل، تصاویر، نقشه ها، نمودار ها، جداول و… صورت گیرد.
