هدف گذاری پایان نامه در واقع اصلی ترین و مهم ترین بخش انجام پایان نامه است. در واقع اولین پایه انجام هر طرح و بخش مطالعاتی تعیین نمودن اهداف می باشد. هدف پایان نامه باید به حالت ایجاد انگیزش و ترغیب مخاطب نگارش شود به نوعی که با خواندن اهداف پایان نامه این بخش برای او خوشایند جلوه کند.
باید به این بخش فکر کنید که خواننده این بخش هر کسی می تواند باشد ولی مهم ترین بخش این قسمت است که طرح تحقیقاتی یا همان پایان نامه شما یک طرح هدفدار و منسجم بوده و حالت نو و جدید بودن آن از اهداف دنبال شده شما مشاهده شود. اهداف پایان نامه ابتدا باید در پروپوزال تنظیم شود و سپس با راه کارها و راه حل هایی که در ادامه آن اتخاذ می شود به پایان نامه عیار و ارزش داده شود.
هدف در پروپوزال نیازهای طرح را مشخص کرده و سپس راه حل مناسب برای رفع آن را در ادامه بیان می نماید و همین بخش نیز نشان دهنده این است که طرح مورد نظر تا چه میزان خوب عمل کرده و قابلیت اجرایی دارد.